Bis zum 31. August 2001 bestand die staatliche Schule in Naturns aus dem Grundschulsprengel mit mehreren Schulstellen, die im Laufe der Jahre z.T. aufgelöst wurden und der Mittelschule. Mit 1. September 2001 wurde neben dem Grundschulsprengel, der unverändert blieb der SSP Naturns gebildet. Dieser setzte sich aus den beiden Grundschulen Tschars und Kastelbell sowie der Mittelschule Naturns zusammen.
Seit 1. September 2007 gibt es den neuen Schulsprengel Naturns. Mit Beschluss der Landesregierung vom 29.01.07 wurden die bis dahin bestehenden beiden Schuldirektionen in Naturns, der Grundschulsprengel (mit den Schulstellen Naturns, Tabland, Staben, Karthaus, Katharinaberg, Unser Frau und Grub) und die Mittelschule Naturns ohne die beiden Grundschulen Kastelbell und Tschars sowie die Grundschule Plaus, die bis dahin vom SSP Partschins verwaltet wurde, zu einem neuen Schulsprengel zusammengeschlossen, dem SSP Naturns.
Mit Ende des Schuljahres 2007/08 wurde die Schulstelle in Grub wegen zu geringer Schülerzahl aufgelassen, so dass sich der neue Schulsprengel nun aus 8 Schulstellen zusammensetzt: die Mittelschule Naturns und die Grundschulen in Naturns, Staben, Tabland, Katharinaberg, Karthaus, Unser Frau und Plaus.
Die Schüler des Schulsprengels Naturns kommen aus drei Gemeinden, den Gemeinden Naturns, Schnals und Plaus.

Diese schulische Organisationsform ist die vorerst letzte seit Beginn der schulischen Aktivität in Naturns.
Die Schulgeschichte in Naturns reicht weit in die Vergangenheit zurück. So schreibt Josef Pircher in der Festschriftbroschüre zur Einweihung der neuen Mittelschule in Naturns (1982), dass Martinus Ritsch 1631 der erste in den Kirchenrechnungen namentlich aufscheinende Schulhalter war, obwohl Pircher annimmt, dass die uralten Heiligtümer St. Prokulus u. St. Zeno bereits im frühen Mittelalter (8. Jh.) nicht nur religiöse sondern auch geistig-kulturelle Strahlungskraft hatten. Im Laufe der weiteren Geschichte gab es dann wie überall verschiedene Änderungen im Schulwesen.
Mit Ende des 2. Weltkrieges wurde dann der Grundschulsprengel errichtet, der damals aus 8 Schulstellen bestand: Naturns, Staben, Tabland, Grub/Ginzl, Unterstell, Fuchsberg, Partscheilberg, Brand. Bis zum Schuljahr 2006/07 hatte der Grundschulsprengel mit unterschiedlichen Schulstellen Bestand.
Die Mittelschule besteht seit dem Schuljahr 1963/64.

Die Direktion mit dem Sekretariat ist im Mittelschulgebäude in Naturns, Feldweg 3 untergebracht.

Die einzelnen Schulstellen der Grundschule sind so organisiert, dass sie von einer Schulstellenleiterin bzw. einem Schulstellenleiter organisatorisch verantwortet werden. Regelmäßige Treffen mit der Schulführungskraft und der Stellvertretung erleichtern die Koordinierung der Tätigkeiten. Dies ist insofern wichtig, weil alle Schülerinnen und Schüler der sieben Grundschulstellen nach der 5. Klasse die Mittelschule in Naturns besuchen.


Die einzelnen Direktionen wurden seit ihrem Bestehen von über 20 Direktorinnen und Direktoren geleitet: